1925年10月14日,國民革命軍第二次東征攻克惠州。東征軍離開惠州繼續(xù)東進時,東征軍總政治部主任周恩來決定留下共產(chǎn)黨員朱祺、共青團員肖鵬魂在惠州設(shè)立東征軍惠州留守處,開展后方群眾工作,支援前線。10月下旬,中共廣東區(qū)委成員阮嘯仙等到惠州視察,決定肖鵬魂等轉(zhuǎn)為中共黨員,于11月建立中共惠州特別支部,朱祺任支部書記。當(dāng)時有30多名中共黨員和共青團員一起活動,多數(shù)為留守處的黃埔軍校學(xué)生,該特支隸屬中共廣東區(qū)委領(lǐng)導(dǎo)。此后,朱祺、肖鵬魂兩人共同負責(zé)黨組織在惠州的工作,并逐步在工農(nóng)群眾和青年學(xué)生中發(fā)展黨員,這些黨員成為惠州學(xué)生運動的核心力量。

廣東省農(nóng)民協(xié)會惠州辦事處舊址和惠陽縣農(nóng)民協(xié)會舊址
惠州特別支部成立后,在其指引下,惠州各地工會、農(nóng)會、青年團、婦女協(xié)會等群眾組織也不斷發(fā)展壯大,從而推動了惠州革命形勢的發(fā)展。1926年1月,廣東省農(nóng)民協(xié)會惠州辦事處成立,負責(zé)指導(dǎo)惠州地區(qū)的惠陽、博羅、河源、龍川、紫金、和平、連平、新豐8縣的農(nóng)運工作,朱祺被任命為辦事處主任。惠州辦事處成立后,協(xié)助惠陽縣農(nóng)會整頓內(nèi)部組織,農(nóng)會組織日益鞏固。
1926年3月,根據(jù)廣東省委指示,撤銷中共惠州特別支部,建立中共惠州地方委員會,由肖鵬魂任書記。中共惠州地委下轄地委機關(guān)支部、惠陽象山特別支部、惠陽鎮(zhèn)隆四大半圍支部、紫金特別支部、龍川特別支部。黨組織的迅速發(fā)展,有力推動了惠州工農(nóng)運動的蓬勃發(fā)展,也為后來反擊國民黨右派叛變革命、進行武裝起義提供了重要的組織保證。